Căn cứ Luật Đầu tư số 67/2014/QH13 ngày 26/11/2014, Nghị định 118/2015/NĐ-CP ngày 12/11/2015 quy định chi tiết và hướng dẫn thi hành một số điều của Luật Đầu tư, Thông tư số 16/2015/TT-BKH ngày 18/11/2015 quy định biểu mẫu thực hiện thủ tục đầu tư và báo cáo hoạt động đầu tư tại Việt Nam, nhằm tạo điều kiện cho việc tiếp nhận và trả thủ tục hành chính theo cơ chế một cửa liên thông được ổn định, nề nếp và đúng theo quy định, Ban Quản lý Khu kinh tế Vân Phong đã xây dựng Quy chế giải quyết thủ tục hành chính theo cơ chế một cửa liên thông tại cơ quan gồm có 08 thủ tục hành chính thuộc lĩnh vực kế hoạch - đầu tư ngoài ngân sách và đã được  UBND tỉnh Khánh Hòa phê duyệt tại Quyết định số 1576/QĐ-UBND ngày 06/6/2016.

Cải cách hành chính là một nhiệm vụ quan trọng, cần thiết cần phải thực hiện thường xuyên và lâu dài nhằm không ngừng nâng cao, hoàn thiện về tổ chức bộ máy và đảm bảo thực thi mọi nhiệm vụ mà Nhà nước giao cho.